Voici les résumés des épisodes de la saison 6 :
Episode 1 : Good mourning
Le personnel hospitalier doit faire face aux conséquences du décès de George. Bouleversés, les médecins trouvent chacun un moyen de surmonter la douleur. De son côté, la mère de George a la difficile tâche de décider quoi faire des organes de son fils.
Episode 2 : Goodbye
Après avoir perdu un des leurs, les médecins se tournent vers chaque distraction qu'ils peuvent trouver. Meredith et Derek semblent consommer leur mariage partout et tout le temps tandis que Cristina et Owen ont reçu pour instruction du docteur Wyatt de s'abstenir d'avoir des rapports sexuels.
Episode 3 : I always feel like somebody's watchin' me
Plusieurs semaines après son expérience de mort imminente, Izzie retourne au travail. Pendant ce temps, les résidents deviennent nerveux et donnent le meilleur d'eux même quand Richard annonce qu'il va y avoir des emplois supprimés à l'hôpital. Enfin, Cristina tente de travailler aux côtés d'Arizona en pédiatrie tandis que Bailey et Alex s'occupent d'une patiente dont le cas complexe est encore compliqué par son fils schizophrène.
Episode 4 : Tainted obligation
Lorsque Thatcher, le père de Meredith et Lexie, arrive à l'hôpital avec le foie malade, c'est à Meredith de lui sauver la vie. Pendant ce temps, Izzie sympathise avec un patient qui a de nombreuses tumeurs tandis que Mark, agacé par la ferveur compétitive de Cristina, l'amène à assister à une opération inhabituelle.
Episode 5 : Invasion
Les médecins du Seattle Grace et de Mercy West rivalisent pour les opérations quand le premier jour de la fusion entre les deux hôpitaux commence. Parallèlement, Arizona soutient Callie, furieuse contre son père qui a engagé un prêtre pour l'aider à la convaincre de sortir avec des hommes. Enfin, Izzie fait l'expérience de la compétition.
Episode 6 : I saw what I saw
Après qu'une victime atteinte de brûlures décède inopinément au beau milieu du chaos qui règne aux urgences, Richard et Jennings interrogent les résidents pour trouver le responsable. Tous les membres de Mercy West et du Seattle Grace défendent leurs actions pour sauver leur emploi.
Episode 7 : Give peace a chance
Quand Isaac, le technicien de laboratoire de l'hôpital, apprend qu'il a une tumeur inopérable enroulée autour de la colonne vertébrale, il se tourne vers Derek pour tenter l'impossible. Ce dernier conteste l'autorité du chef quand Richard refuse de le laisser réaliser une opération si risquée.
Episode 8 : Invest in love
Un généreux don est offert au Seattle Grace par les parents d'un enfant de dix ans dont s'occupe Arizona. Cependant, lorsque son état s'aggrave, la jeune femme se retrouve dans une situation de conflit d'intérêts. Pendant ce temps, un conflit naît entre Owen et Cristina quand cette dernière prend des risques lors d'une opération. Enfin, Alex se retrouve avec toutes les factures d'hôpital d'Izzie à payer.
Episode 9 : New history
Quand Owen recrute Teddy Altman, une de ses anciennes collègues de la guerre en Irak, pour devenir la nouvelle chirurgienne cardio-thoracique du SGH, Cristina se pose des questions sur les capacités de sa supérieure au bloc opératoire ainsi que sur la nature des relations qu'elle entretenait avec Owen dans le passé. Pendant ce temps, Izzie retourne à l'hôpital avec son mentor, demandent un traitement pour sa démence. Enfin, le stress que Richard a accumulé depuis la fusion commence à se faire ressentir.
Episode 10 : Holidaze
C'est la saison des fêtes et Miranda reçoit la visite de son père, William, qui désapprouve ses choix de vie. Pendant ce temps, Lexie et Mark doivent faire face à l'arrivée choquante d'une femme du passé de Mark. Enfin, Thatcher Grey se pose des questions au sujet du comportement de Richard mais Meredith prend sa défense.
Episode 11 : Blink
Mark fait venir Addison à Seattle afin qu'elle s'occupe d'une procédure difficile à effectuer sur sa fille enceinte. Owen se pose des questions sur les motivations de Teddy quand elle attribue à Cristina une intervention chirurgicale compliquée. Enfin, Derek devient soupçonneux quand Richard embauche Meredith pour l'assister sur une opération à risques.
Episode 12 : I like you so much better when you're naked
Après avoir pris connaissance des problèmes d'alcool de Richard, Derek le confronte pour son bien ainsi que celui de l'hôpital. Izzie revient avec l'espoir de se réconcilier avec Alex tandis que la tension monte entre Teddy, Cristina et Owen suite à une surprenante révélation de Cristina.
Episode 13 : State of love and trust
Alors que Derek prend ses fonctions de chef intérimaire, il doit faire face à un procès potentiel quand un patient de Bailey et Meredith se réveille au beau milieu de son opération. Pendant ce temps, Teddy refuse de prendre Cristina dans son service, Arizona teste Alex sur ses capacités en pédiatrie et Mark refuse de parler à Lexie.
Episode 14 : Valentine's Day Massacre
